Estas floras têm duas localizações principais:
- a camada descamante (stratum disjonctum), onde as células se separam umas das outras, criando espaços vazios que constituem um excelente meio para o desenvolvimento bacteriano;
- o funil folicular, ou infudibilum, que favorece igualmente o desenvolvimento bacteriano: sebo, fragmentos de queratina, temperatura elevada e meio anaeróbio exercem influência.

O número de germes saprófitos é variável de um indivíduo a outro e em média é de alguns milhões por centímetro quadrado, conforme as partes do corpo.
A flora saprófita e a flora patogênica se mantém em equilíbrio e o desenvolvimento desta última é limitado, graças à presença da primeira.
A flora saprófita participa da defesa contra a infecção, mas é preciso evitar que ela tenha um desenvolvimento muito importante que provocaria uma situação patológica.

1. Flora cutânea bacteriana
São, sobretudo, os microorganismos gram-positivos, aeróbios ou anaeróbios, entretanto, às vezes há os gram-negativos.

Gram-positivos
- os estafilococos, como S.epidermidis e S. albus, encontram-se na superfície cutânea, sobretudo, no nível dos cabelos e dos espaços interdigitais.

A presença do S. aureus é devida a uma contaminação, podendo tornar-se patogênica.
- Os micrococus, como M. saccarolyticus, M. candidus, M. flaus, estão presentes no couro cabeludo, nas axilas, entre os dedos dos pés.
- Os Corynebacterium.

Estão muito espalhados em todos os indivíduos, sobretudo, nos que apresentam pele gordurosa, pois seu crescimento é favorecido pelos constituintes do sebo.

Alguns são aeróbios, como C. acne, que se desenvolve no funil folicular.
- Os estreptococus são bastante raros.

Gram-negativos
Não estão permanentemente presentes, mas pode-se encontrá-los, às vezes, nas zonas úmidas.
- Os proteus, no nível dos artelhos;
- E.coli, no nível do períneo;
- Pseudomas aeruginosa cada vez mais freqüente,

2. Flora cutânea fúngica
Sua população aumenta em algumas circunstâncias, como nas modificações de umidade cutânea, do pH, na falta de higiene, no emprego abusivo de antibióticos, desencadeando a aparição de micoses.

Esta flora é constituída por:
- os Pityrospurum
P. orbiculare é o agente do pityriasis versicolor.
P. ovale, no nível do couro cabeludo, provocaria a aparição de descamação;
- as Cândida.
C. albican, geralmente saprófito de mucosas, pode tornar-se patogênico em certas condições;
- os dermatófitos são os agentes das tinhas e das sicoses;
- os Asperligillus e Penicillium estão igualmente presentes nos cabelos, na barba, entre os dedos dos pés e no nível das unhas.